DVDヱヴァンゲリヲン新劇場版：序（EVANGELION:1.01 YOU ARE（NOT）ALONE）特装版于2008年4月24日正式发售。全日本秋叶原ACG向商店全面上架以统一售价贩卖开始。特装版DVD有特殊的BOX式样，分DVD2枚组，解说Booklet，剧场版上映用底片。据购买者声称，底片中含有大量男子厕所小便槽！

　　EVA新剧场版总监督庵野秀明氏在DVD Booklet中写道：“在这12年间没有比EVA更新颖的动画片了，撇开停滞的现代技术论不谈，表现志向才是最重要的。”“（新）EVA是循环往复的故事。在同一个故事中用不同的形式去表现变化而制作成了四部作品（剧场版），如果能喜欢的话我感到荣幸。”